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coolwulf
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在 D 版发过了,不过因为不少朋友看不到 D 版,我就放在这里吧,说说我最近做的这个 Project

  •  201
    &nbp;
  •   coolwulf 2018-06-13 05:39:11 +08:00 46457 次点击
    这是一个创建于 2678 天前的主题,其中的信息可能已经有所发展或是发生改变。

    去年的时候,我一个在芝加哥比我小几级的南京大学校友去世了。乳腺癌,发现得晚了,才 34 岁,留下了一个 4 岁的孩子。非常可惜。想想能不能做点什么事情可以帮助大众来提高乳腺癌的早期检测成功率。因为如果在 stage 1 发现乳腺癌的话,5 年存活率是 99%。

    想想能否写一个完全免费的网站和 ios app 来让用户可以迅速得到 X-ray Mammogram 的诊断结果。至少可以是 2nd Opinion. 因为用户做完 Mammography 之后有时候需要等好几天才能有 Radiologist 来读片子。而且现在 Radiologist 有 20% 的概率会漏掉早期的肿瘤。我决定用 Deep Learning (深度学习) 来做这件事情。

    对于一个足够好的 Deep Learning Model, 一是要有足够多的数据 (即使是做 Transfer Learning 的情况下), 二是要有足够强大的计算力。为了做成这件事情,我在本地搭建了一个 50 个 Nvidia Geforce GTX 1080 Ti 的 GPU cluster, 这是搭成之后的硬件:

    有了硬件之后就是设计 Model 和收集数据。我从北美和欧洲的几个研究组获取了 Annotated Breast Mammo 的数据。这些 Annotation 大多都是根据北美 ABR certified 的 Radiologist 做出的。也就是如果这个 Model 能够训练好,就可以达到 ABR Certified Radiologist 的 Reading 的平均水平或者更好。

    最终的结果我在欧洲的 InBreast 数据上做了测试,达到了 90% 的准确度 (AUC).

    我觉得这个 Model 已经可以给大众实用了,在这里公开出来:

    http://neuralrad.com

    你可以直接上传 .jpg 形式的 Mammo 图片,这个 AI 会给出判断结果. 这是 Screenshot:

    这个网站是完全免费使用的。我现在还在继续更新和改进 Model, 也在联系国内的几家医院来合作来获取更多的数据来 Training.

    University of Kentucky Hospital 和国内的一家合作公司已经在测试了这个模型

    乳腺癌检查去年有个全世界竞赛,他们先用这个竞赛获得第二名程序测试了 MIAS 数据,漏了 10 个 case, 然后他们用我的网站测试了一下,只漏了一个

    这个第二名程序发表了一篇自然杂志的论文:

    https://www.nature.com/articles/s41598-018-22437-z

    这两天,我也公布了完全免费的桌面版本,支持读取和浏览 dicom 文件,并自动转换 Normalize for AI analysis. 在 InBreast 的 Dicom 数据上 AUC (准确率)大概 93%。桌面版本截图:

    下载地址就在网页主页上。

    [06/12/2018 更新] NeuralRad Mammo AI 桌面版本更新到了 1.2, 修复 dicom/jpg 文件路径有中文或者空格导致无法返回正确结果的问题。依然从主页 http://neuralrad.com 免费下载

    第 1 条附言    2018-07-18 03:08:25 +08:00
    [07/17 更新 桌面版本 1.4]

    + 修复标注的一个 bug
    + 标注保存文件 annotation.txt 保存在图像当前目录下
    312 条回复    2022-06-01 16:48:04 +08:00
    1  2  3  4  
    vegito2002
        1
    vegito2002  
       2018-06-13 05:40:59 +08:00   12
    V 站卧虎藏龙说的就是楼主这样的人了. 支持一下
    vegito2002
        2
    vegito2002  
       2018-06-13 05:42:21 +08:00   7
    楼主考虑过联系学界的朋友发个文章吗? 感觉很有利于推广
    ynyounuo
        3
    ynyounuo  
       2018-06-13 06:03:33 +08:00 via iPhone
    哇,this is something
    ech0x
        4
    ech0x  
       2018-06-13 06:13:32 +08:00 via iPhone
    这个真的好厉害。
    Baymaxbowen
        5
    Baymaxbowen  
       2018-06-13 06:30:58 +08:00 via Android
    真的很赞
    towser
        6
    towser  
       2018-06-13 06:36:51 +08:00
    可以说是科技之光了
    WildCat
        7
    WildCat  
       2018-06-13 06:43:38 +08:00
    给楼主献上膝盖,50x 1080Ti + 这么大的房子 + free

    佩服。

    看了下楼主的经历,真大佬
    airyland
        8
    airyland  
       2018-06-13 07:19:59 +08:00 via iPhone
    佩服
    cnkiller
        9
    cnkiller  
       2018-06-13 07:24:16 +08:00 via Android
    d 版观光团路过
    RyuZheng
        10
    RyuZheng  
       2018-06-13 07:43:14 +08:00 via iPhone   2
    厉害,虽然免费开放,但楼主应该考虑发科研 paper 或者申请专利,你虽然可以免费,但是如果别人根据你的成果,仿制一个,或者收费,你可能无法保护自己的成果。
    qdwang
        11
    qdwang  
       2018-06-13 07:52:18 +08:00 via iPhone
    感谢楼主,不知道推广到其他不同类型的疾病难度有多大呢?
    agdhole
        12
    agdhole  
       2018-06-13 08:00:37 +08:00
    厉害
    exp1ore
        13
    exp1ore  
       2018-06-13 08:05:29 +08:00
    感谢
    thinkIn
        14
    thinkIn  
       2018-06-13 08:08:56 +08:00 via iPhone
    真大佬!
    Daming
        15
    Daming  
       2018-06-13 08:09:13 +08:00 via Android
    赞一个,希望后面能推广到其他疾病的前期检测。
    Willjim
        16
    Willjim  
       2018-06-13 08:11:57 +08:00 via Android
    楼主这样真的太强了,用技术拯救世界。
    Gran1987
        17
    Gran1987  
       2018-06-13 08:18:56 +08:00 via iPhone
    谢谢!
    blessme
        19
    blessme  
       2018-06-13 08:22:04 +08:00
    50 张电老虎,功耗多大?
    Duolingo
        20
    Duolingo  
       2018-06-13 08:29:20 +08:00 via Android
    赞大佬哇
    打个岔,如果做大了注意政策风险,就我所知国内医疗数据这一块,IBM 的沃森都动不了
    lxy42
        21
    lxy42  
       2018-06-13 08:38:03 +08:00 via Android
    awesome
    UnPace
        22
    UnPace  
       2018-06-13 08:40:55 +08:00
    支持,这样的创造太棒了
    Removable
        23
    Removable  
       2018-06-13 08:42:03 +08:00
    给大佬赞一个!

    顺便问一下啥是 D 版?
    ebony0319
        24
    ebony0319  
       2018-06-13 08:45:02 +08:00
    真的好厉害!
    wingkou
        25
    wingkou  
       2018-06-13 08:45:26 +08:00 via Android
    SamaelWang
        26
    SamaelWang  
       2018-06-13 08:45:50 +08:00 via Android
    支持一下,加油
    reeco
        27
    reeco  
       2018-06-13 08:49:25 +08:00 via iPhone
    HBpencil
        28
    HBpencil  
       2018-06-13 08:50:45 +08:00 via Android
    好厉害
    zj299792458
        29
    zj299792458  
       2018-06-13 08:51:06 +08:00 via iPhone
    有钱,任性……
    taifu
        30
    taifu  
       2018-06-13 08:53:20 +08:00 via Android
    支持
    torment5524
        31
    torment5524  
       2018-06-13 08:57:28 +08:00
    科技造福人类,感谢题主。
    看片子全靠人工经验确实会带来不少悲剧。
    golmic
        32
    golmic  
       2018-06-13 08:59:33 +08:00 via Android
    感谢楼主~
    zhou00
        33
    zhou00  
       2018-06-13 08:59:37 +08:00
    感谢大佬做出的贡献!
    alect
        34
    alect  
       2018-06-13 09:01:48 +08:00
    膜拜下大佬!
    asaxing
        35
    asaxing  
       2018-06-13 09:03:36 +08:00 via Android
    感觉这才是极客应该做的,虽然用不到,但还是感谢楼主
    Tarkky
        36
    Tarkky  
       2018-06-13 09:05:24 +08:00 via Android
    LZ 好厉害。支持
    maichael
        37
    maichael  
       2018-06-13 09:07:20 +08:00
    支持。
    youxiachai
        38
    youxiachai  
       2018-06-13 09:09:15 +08:00   1
    @Removable hi-pda... 一个有快 20 年历史的论坛了..
    abowloflrf
        39
    abowloflrf  
       2018-06-13 09:09:59 +08:00 via iPhone
    太棒了
    dudu431
        40
    dudu431  
       2018-06-13 09:15:51 +08:00
    服气,支持。
    Verydiao
        41
    Verydiao  
       2018-06-13 09:18:46 +08:00
    同样是 1080,有的用来游戏,有的用来挖矿......传说中的活菩萨就是大佬你了。。。用技术造福人类的典型。
    patx
        42
    patx  
       2018-06-13 09:19:39 +08:00 via Android
    佩服大神有能力为社会贡献价值
    wjm2038
        43
    wjm2038  
       2018-06-13 09:25:06 +08:00 via Android
    真的牛逼
    Pepsigold
        44
    Pepsigold  
       2018-06-13 09:25:17 +08:00
    虽然免费开放,但楼主应该考虑发科研 paper 或者申请专利,你虽然可以免费,但是如果别人根据你的成果,仿制一个,或者收费,你可能无法保护自己的成果。

    同样建议!!!
    ccl945
        45
    ccl945  
       2018-06-13 09:33:29 +08:00
    来自 D 版的大佬
    lovestudykid
        46
    lovestudykid  
       2018-06-13 09:40:06 +08:00
    不是说还不如人工么,吴恩达都被 diss 了
    venhow
        47
    venhow  
       2018-06-13 10:02:26 +08:00
    厉害。
    qinxi
        48
    qinxi  
       2018-06-13 10:15:42 +08:00
    厉害了我的哥
    EVJohn
        49
    EVJohn  
       2018-06-13 10:28:59 +08:00
    可以 donate 吗
    xjoker
        50
    xjoker  
       2018-06-13 10:36:55 +08:00
    厉害了大佬
    onlyice
        51
    onlyice  
       2018-06-13 10:37:30 +08:00
    感谢楼主,我的回复虽然很水,但是这种帖子必须支持
    xiaket
        52
    xiaket  
       2018-06-13 10:38:02 +08:00
    话说那位 nju 校友可是 01chem 的 zh?
    ke1e
        53
    ke1e  
       2018-06-13 10:38:17 +08:00 via Android
    真正的回报社会
    ha0719
        54
    ha0719  
       2018-06-13 10:38:25 +08:00
    牛逼
    woyao
        55
    woyao  
       2018-06-13 10:41:02 +08:00
    人类未来的希望
    ichirou
        56
    ichirou  
       2018-06-13 10:42:56 +08:00
    厉害了大佬
    Felldeadbird
        57
    Felldeadbird  
       2018-06-13 10:43:15 +08:00
    大佬真的为人类做出了贡献啊!
    Cambrian07
        58
    Cambrian07  
       2018-06-13 10:43:45 +08:00 via Android
    真的很厉害了,一定要发 paper 之类的
    U7Q5tLAex2FI0o0g
        59
    U7Q5tLAex2FI0o0g  
       2018-06-13 10:45:21 +08:00
    真丶大佬,膜拜
    lijsh
        60
    lijsh  
       2018-06-13 10:47:03 +08:00
    从 D 版追随而来,楼主加油。
    qq976739120
        61
    qq976739120  
       2018-06-13 10:48:05 +08:00
    支持楼主这样的人才
    dbsquirrel
        62
    dbsquirrel  
       2018-06-13 10:48:59 +08:00 via iPhone
    牛逼……
    imnpc
        63
    imnpc  
       2018-06-13 10:52:53 +08:00
    这个 是真正的牛 X 项目啊
    hansnow
        64
    hansnow  
       2018-06-13 10:55:47 +08:00
    来自 D 版带着
    green15
        65
    green15  
       2018-06-13 10:58:21 +08:00 via iPhone
    达则兼济天下,楼主是我学习的榜样
    wha2020
        66
    wha2020  
       2018-06-13 11:01:36 +08:00
    真正的科技改变生活,钦佩
    yybeta
        67
    yybeta  
       2018-06-13 11:06:08 +08:00
    佩服!为你点赞!
    wvc
        68
    wvc  
       2018-06-13 11:07:25 +08:00
    那些整天炫耀自己的超算多快多牛逼的脸红不?牛逼应该体现在实用上,而不是数据。为楼主点赞!
    kidding
        69
    kidding  
       2018-06-13 11:08:21 +08:00
    哇 dalao
    真的厉害
    alexsunxl
        70
    alexsunxl  
       2018-06-13 11:08:51 +08:00
    默默的点个收藏先
    ayanamist
        71
    ayanamist  
       2018-06-13 11:09:33 +08:00
    机器学习阅片这事,国内好像都已经搞过比赛了。另外好几天才有人阅片,也是国外特色。楼主这帖子,更适合去 reddit 宣传……
    haiyangcn
        72
    haiyangcn  
       2018-06-13 11:11:22 +08:00
    膜拜一下
    wupher
        73
    wupher  
       2018-06-13 11:11:46 +08:00
    了不起!
    droiz
        74
    droiz  
       2018-06-13 11:12:58 +08:00
    支持楼主!!!
    Pepsigold
        75
    Pepsigold  
       2018-06-13 11:15:10 +08:00   1
    qcloud
        76
    qcloud  
       2018-06-13 11:18:17 +08:00
    了不起!
    EVAb00
        77
    EVAb00  
       2018-06-13 11:21:06 +08:00
    厉害了,赞一个。
    tiiime
        78
    tiiime  
       2018-06-13 11:23:16 +08:00
    想帮忙写 app
    bullettrain1433
        79
    bullettrain1433  
       2018-06-13 11:23:38 +08:00
    支持楼主!!!
    youngxu
        80
    youngxu  
       2018-06-13 11:24:14 +08:00 via Android
    lz 也是南大校友?用现在数理大类的话讲,nb !
    butterflydog
        81
    butterflydog  
       2018-6-13 11:24:52 +08:00
    赞一个
    breaklayer
        82
    breaklayer  
       2018-06-13 11:29:30 +08:00
    you are so cool
    xxhjkl
        83
    xxhjkl  
       2018-06-13 11:34:59 +08:00
    显卡看病牛 XXXXXX
    ScotGu
        84
    ScotGu  
       2018-06-13 11:41:05 +08:00
    了不起的事情!
    通过创意来造福社会。
    keepit
        85
    keepit  
       2018-06-13 11:41:17 +08:00
    膜拜大佬
    deepurple
        86
    deepurple  
       2018-06-13 11:43:37 +08:00
    This is so fucking cool
    cat9life
        87
    cat9life  
       2018-06-13 11:43:59 +08:00
    支持!大佬牛掰
    RangerWolf
        88
    RangerWolf  
       2018-06-13 11:44:01 +08:00
    佩服 膜拜
    abmin521
        89
    abmin521  
       2018-06-13 11:46:00 +08:00
    支持

    后期能添加主机,利用一下别人闲置的 GPU 也是可以的
    MoozLee
        90
    MoozLee  
       2018-06-13 11:46:38 +08:00
    支持
    icekingcy
        91
    icekingcy  
       2018-06-13 11:54:13 +08:00 via iPhone
    支持!
    coolwulf
        92
    coolwulf  
    OP
       2018-06-13 12:05:02 +08:00   6
    刚刚 CCF 那边有朋友通知我了才知道。想想上次上 CB 的新闻可能都超过十年了。希望这个免费网站和 Model 能够给国内的 Breast cancer early diagnostic 带来一点作用吧。那这几个月的工作就没有白费。
    carakan
        93
    carakan  
       2018-06-13 12:06:57 +08:00 via Android
    给大佬点个赞。。顺便首下我的膝盖
    boris1993
        94
    boris1993  
       2018-06-13 12:16:17 +08:00 via Android
    大佬大佬,赞一个,精神支持
    另外留心保护自己的成果
    banxi1988
        95
    banxi1988  
       2018-06-13 12:23:22 +08:00
    叹为观止。
    fate
        96
    fate  
       2018-06-13 12:23:50 +08:00
    赞赞赞
    riciny
        97
    riciny  
       2018-06-13 12:26:17 +08:00
    大神 NB,赞一个
    plidezus
        98
    plidezus  
       2018-06-13 12:28:03 +08:00   28
    Hi,coolwulf

    我是丁香园的首席产品架构师少楠,早上看到你这个项目,我想我们应该能给你提供一些脱敏的数据来加强训练,目前我们有几百万的医生病例讨论及用户在线咨询。

    如果方便请联系我 [email protected]
    lkxlaz
        99
    lkxlaz  
       2018-06-13 12:29:16 +08:00 via Android
    厉害 支持!
    F1024
        100
    F1024  
       2018-06-13 12:33:25 +08:00
    哇哇哇 真正的人才 比那些挖矿投机的 高了不止百倍
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